Anualmente, são oferecidas seis vagas para o programa, cuja duração é de três anos.
O programa de residência médica em Oftalmologia do Complexo Hospitalar Padre Bento de Guarulhos é credenciado junto ao Conselho Brasileiro de Oftalmologia.
A seleção pública é conduzida em conjunto com os demais programas de residência médica do Sistema Único de Saúde da Secretaria Estadual de Saúde de São Paulo (SUS-SP).